जैसे-जैसे आधुनिक सीएनसी प्रणाली की विश्वसनीयता बढ़ती जा रही है, सीएनसी प्रणाली के दोष स्वयं कम और कम होते जा रहे हैं, और अधिकांश दोष गैर-प्रणालीगत कारणों से होते हैं।सिस्टम के बाहरी दोष मुख्य रूप से डिटेक्शन स्विच, हाइड्रोलिक घटकों, वायवीय घटकों, विद्युत सक्रिय घटकों, यांत्रिक उपकरणों आदि के कारण होने वाली समस्याओं को संदर्भित करते हैं।
संख्यात्मक नियंत्रण उपकरण के बाहरी दोषों को बाहरी हार्डवेयर क्षति के कारण होने वाले सॉफ़्टवेयर दोषों और कठोर दोषों में विभाजित किया जा सकता है।
नरम दोष अनुचित संचालन और समायोजन के कारण होते हैं।इस तरह के दोष अक्सर उपकरण उपयोग के प्रारंभिक चरण में या उपकरण उपयोगकर्ताओं की समायोजन अवधि के दौरान होते हैं।
सीएनसी प्रणाली के लिए, एक अन्य संकटग्रस्त स्थान सर्वो इकाई है।क्योंकि गेंद के पेंच को चलाने के लिए सर्वो मोटर को नियंत्रित करने वाली सर्वो इकाई द्वारा प्रत्येक अक्ष की गति का एहसास होता है।
रोटरी एन्कोडर का उपयोग गति प्रतिक्रिया के लिए किया जाता है, और झंझरी शासक का उपयोग स्थिति प्रतिक्रिया के लिए किया जाता है।आमतौर पर, रोटरी एनकोडर और सर्वो यूनिट के ड्राइविंग मॉड्यूल के विफल होने का खतरा होता है।
बिजली आपूर्ति के कारण व्यक्तिगत सिस्टम अराजकता भी है।खासतौर पर उन सिस्टम्स के लिए जिनके पास डेटा को सेव करने के लिए कंप्यूटर की हार्ड डिस्क है।